FLCL: Наота Нандаба
Наота Нандаба — главный герой. Юноша, старающийся быть, как все. Школьник 12-ти лет, брат которого уехал играть в бейсбол в Америку, отец – великовозрастный отаку, дед – старый извращенец. Мамими – девушка брата, с которой Наота тусуется по вечерам – на редкость странная персона и смотрит на него, как на ребенка.
FLCL: Харуко Харухара
Харуко Харухара или Рахару Харуха — инопланетянка. Играет на бас-гитаре Rickenbacker 4001. Главная цель прибытия на Землю — поиск Атомска. Любит эпатировать публику, пренебрегает чужими интересами. Средство передвижения: космический корабль в виде мотороллера Vespa 180 SS.
FLCL: Мамими Самэдзима
Мамими Самэдзима — девушка старшего брата Наоты. Учится в старшей школе, не работает. Чаще всего можно найти её под Мостом. Есть ручное животное Та-кун — кот. Собственно говоря, Та-куном она называет любое существо мужского пола. Включая Наоту. Курит.
FLCL: Амарао
Амарао — командующий филиалом «иммиграционного бюро для инопланетян» в Мабасэ. Обладает бровями впечатляющих размеров (впоследствии оказывается, что брови — приклеенные). Средство передвижения: мотороллер Rabbit 301.
FLCL: Наота Нандаба 
